Входной файл для Material Studio

[ChemNata20]

Подскажите, пожалуйста, как создать входной файл для Material Studio.

[Гесс]

Вопрос непонятен. В материалСтудию (далее MS) можно импортировать редкостное множество форматов, начиная с cif и xyz. Они будут визуализированы и будут частью проекта (если вы скажете сохранить изменеия закрывая файл и проект). Далее изображенную структуру можно скармливать модулям которые есть в MS (навскидку там VAMP, CASTEP, DFTB и еще десяток каких то, я не использую MS для расчетов). В меню каждого модуля вы указываете желаемые опции, после чего создается инпут который можно сразу запускать или сохранить для экспорта (можно и редактировать инпут так как меню создания как минимум в случае VAMPа игнорирует минимум 2/3 возможных фишек). Обычно для каждого расчета создается новая папка внутри проекта или внутри предыдущей папки. Для каждого модуля разумеется свой формат инпута. Предназначение собственного формата MS (xsd или как то так) мне осталось непонятным. Вывод структур из MS я делаю через Экспорт, обычно в формате pdb.
Уточните вопрос и если это необходимо - приложите картинку чего вы хотите/неможете сделать.

[ChemNata20]

Спасибо большое за ответ. Мне необходимо посчитать Density of ststes (Modules/Castep/Calculation). Я загружаю файл с геометрией в формате .xyz. А что дальше делать, чтобы сформировался входной, не могу понять.

[ChemNata20]

И как задавать параметры, например число итераций

[Гесс]

somescreenshots.pdf

Так лучше? показано окно где менять число итераций и выбирать денсити офстейтс. показано начало ранящйся задачи

[Гесс]

Кто из сгенерированных файлов = инпут кастепа сказать затрудняюсь. Скорее всего в роли инпута выступает файл с параметрами, а ячейка с координатами идет отдельно.
Кастеп помоему работает только в периодике. И я не уверен что материалстудия понимает периодические структуры в "псевдоxyz" формате (xyz c векторами в конце, такое мало кто понимает). Так что добывайте cif.

[ChemNata20]

Спасибо Вам большое!!!!

[ChemNata20]

А в каком формате вы загружаете свою исходную геометрию? И в ней прописываете параметры ячейки взятой из файла cif?

[ChemNata20]

Я читала что исходные файлы с расширениями .cell и .param

[Гесс]

Нет, я просто гружу cif. Если cifa нет то дело швах. Выкрутиться наверняка можно, но это уже "Хорошо что это ваша проблема а не моя".
Вы хотите вручную эдитить .cell файл?
Гм. Ну это конечно вариант как обойтись без cif, но надо смотреть формат этого .cell-a, возможно проще Build crystal в MS.

В ходе расчета у меня есть
*** Convergence.xcd
*** Energies.xcd
***.castep
.castep_bin
.cell
.geom
.kptaux
.param
.trj
.trjaux
.xsd
.xtd
_DOS.cell
_DOS.kptaux
_DOS.param
SMCastep_Extension_***.xms
Status.txt
Это при отсмотре в файловом менеджере (FileZilla), в списке файлов матстудии и в папке винды отображается меньше половины этого списка.