В одной из статей видел что используют в вычислениях разные basis sets для различных атомов в молекуле, к примеру метал вычисляется одним, азот другим а углерод третим basis set.
Дайте пожалуста пример файла где использован такой метод вычисления.
Разные basis sets для разных элементов?
Разные basis sets для разных элементов?
cogito ergo sum
Re: Разные basis sets для разных элементов?
Каким пакетом пользуетесь-то? 

Racing is better than sex. The quicker you finish, the better you are.
Re: Разные basis sets для разных элементов?
Прошу простить
Я действительно не указал софт. Пользуюсь Gaussian98.

Я действительно не указал софт. Пользуюсь Gaussian98.
cogito ergo sum
Re: Разные basis sets для разных элементов?
Вот пример со внешним ECP базисом для Zr:
------------------------
%mem=512Mb
#p opt=z-matrix pbepbe/genecp
Cp2ZrCl2 (PBE/ECP28MHF)
0 1
C
C 1 1.4
C 2 1.4 1 108.0
C 1 1.4 2 108.0 3 -1.0
C 4 1.4 1 108.0 2 1.0
H 1 1.1 2 126.0 4 178.0
H 2 1.1 3 126.0 1 177.0
H 3 1.1 2 126.0 1 179.0
H 4 1.1 5 126.0 1 -177.0
H 5 1.1 4 126.0 1 -179.0
Zr 1 2.6 2 74.0 3 65.0
C 11 2.6 1 173.0 6 1.0
C 12 1.4 11 74.0 1 -125.0
C 13 1.4 12 108.0 11 -65.0
C 12 1.4 13 108.0 14 1.0
C 15 1.4 12 108.0 13 -1.0
H 12 1.1 13 126.0 15 -178.0
H 13 1.1 14 126.0 12 -177.0
H 14 1.1 13 126.0 12 -179.0
H 15 1.1 16 126.0 12 177.0
H 16 1.1 15 126.0 12 179.0
Cl 11 2.5 1 87.0 6 49.0
Cl 11 2.5 1 88.0 6 -51.0
C 0
aug-cc-pvdz
****
Zr 0
S 3 1.0
5.8737890 -0.8394311
4.2872700 1.4322944
1.4641370 0.3960967
S 1 1.0
0.8312450 1.0
S 1 1.0
0.3623350 1.0
S 1 1.0
0.0793570 1.0
S 1 1.0
0.0339200 1.0
S 1 1.0
0.0110000 1.0
P 2 1.0
2.8742240 -4.1490377
2.1199010 3.8441952
P 2 1.0
0.8513640 0.5739450
0.4372920 0.4590635
P 1 1.0
0.2029040 1.0
P 1 1.0
0.0632590 1.0
P 1 1.0
0.0225230 1.0
D 4 1.0
2.5801370 -0.0915734
1.8553960 0.2237318
0.6807540 0.4769343
0.2566910 0.5279852
D 1 1.0
0.0894000 1.0
D 1 1.0
0.0300000 1.0
****
Cl 0
aug-cc-pvdz
****
H 0
aug-cc-pvdz
****
Zr 0
Zr-ECP 4 28
G POTENTIAL
1
2 1.000000 0.000000
S-G POTENTIAL
2
2 7.820000 146.202289
2 3.910000 18.323348
P-G POTENTIAL
2
2 6.990000 99.859830
2 3.500000 13.655859
D-G POTENTIAL
2
2 5.440000 32.237066
2 2.660000 7.660252
F-G POTENTIAL
2
2 7.510000 -21.069954
2 3.770000 -3.113384
------------------------
------------------------
%mem=512Mb
#p opt=z-matrix pbepbe/genecp
Cp2ZrCl2 (PBE/ECP28MHF)
0 1
C
C 1 1.4
C 2 1.4 1 108.0
C 1 1.4 2 108.0 3 -1.0
C 4 1.4 1 108.0 2 1.0
H 1 1.1 2 126.0 4 178.0
H 2 1.1 3 126.0 1 177.0
H 3 1.1 2 126.0 1 179.0
H 4 1.1 5 126.0 1 -177.0
H 5 1.1 4 126.0 1 -179.0
Zr 1 2.6 2 74.0 3 65.0
C 11 2.6 1 173.0 6 1.0
C 12 1.4 11 74.0 1 -125.0
C 13 1.4 12 108.0 11 -65.0
C 12 1.4 13 108.0 14 1.0
C 15 1.4 12 108.0 13 -1.0
H 12 1.1 13 126.0 15 -178.0
H 13 1.1 14 126.0 12 -177.0
H 14 1.1 13 126.0 12 -179.0
H 15 1.1 16 126.0 12 177.0
H 16 1.1 15 126.0 12 179.0
Cl 11 2.5 1 87.0 6 49.0
Cl 11 2.5 1 88.0 6 -51.0
C 0
aug-cc-pvdz
****
Zr 0
S 3 1.0
5.8737890 -0.8394311
4.2872700 1.4322944
1.4641370 0.3960967
S 1 1.0
0.8312450 1.0
S 1 1.0
0.3623350 1.0
S 1 1.0
0.0793570 1.0
S 1 1.0
0.0339200 1.0
S 1 1.0
0.0110000 1.0
P 2 1.0
2.8742240 -4.1490377
2.1199010 3.8441952
P 2 1.0
0.8513640 0.5739450
0.4372920 0.4590635
P 1 1.0
0.2029040 1.0
P 1 1.0
0.0632590 1.0
P 1 1.0
0.0225230 1.0
D 4 1.0
2.5801370 -0.0915734
1.8553960 0.2237318
0.6807540 0.4769343
0.2566910 0.5279852
D 1 1.0
0.0894000 1.0
D 1 1.0
0.0300000 1.0
****
Cl 0
aug-cc-pvdz
****
H 0
aug-cc-pvdz
****
Zr 0
Zr-ECP 4 28
G POTENTIAL
1
2 1.000000 0.000000
S-G POTENTIAL
2
2 7.820000 146.202289
2 3.910000 18.323348
P-G POTENTIAL
2
2 6.990000 99.859830
2 3.500000 13.655859
D-G POTENTIAL
2
2 5.440000 32.237066
2 2.660000 7.660252
F-G POTENTIAL
2
2 7.510000 -21.069954
2 3.770000 -3.113384
------------------------
Re: Разные basis sets для разных элементов?
Даный ввод логичен?
Ради примера использовал просто молекулу этанола:
%mem=6MW
%nproc=1
# opt=(tight) hf/gen scf=(qc,tight,direct,maxcycle=1000)
ethanol example
0 1
C
H 1 B1
H 1 B2 2 A1
C 1 B3 2 A2 3 D1
H 4 B4 1 A3 2 D2
H 4 B5 1 A4 2 D3
H 4 B6 1 A5 2 D4
O 1 B7 4 A6 5 D5
H 8 B8 1 A7 4 D6
B1 1.08524010
B2 1.08524010
B3 1.52454066
B4 1.08205877
B5 1.08205877
B6 1.08362390
B7 1.44434552
B8 0.96606627
A1 108.14929326
A2 110.18470376
A3 109.49555185
A4 109.49555185
A5 110.87721903
A6 106.19779937
A7 110.85780472
D1 120.48957464
D2 61.00929257
D3 179.73288693
D4 -59.62891025
D5 -59.36179718
D6 180.00000000
O 0
6-311++g(2p)
****
C H 0
3-21g
****
Ради примера использовал просто молекулу этанола:
%mem=6MW
%nproc=1
# opt=(tight) hf/gen scf=(qc,tight,direct,maxcycle=1000)
ethanol example
0 1
C
H 1 B1
H 1 B2 2 A1
C 1 B3 2 A2 3 D1
H 4 B4 1 A3 2 D2
H 4 B5 1 A4 2 D3
H 4 B6 1 A5 2 D4
O 1 B7 4 A6 5 D5
H 8 B8 1 A7 4 D6
B1 1.08524010
B2 1.08524010
B3 1.52454066
B4 1.08205877
B5 1.08205877
B6 1.08362390
B7 1.44434552
B8 0.96606627
A1 108.14929326
A2 110.18470376
A3 109.49555185
A4 109.49555185
A5 110.87721903
A6 106.19779937
A7 110.85780472
D1 120.48957464
D2 61.00929257
D3 179.73288693
D4 -59.62891025
D5 -59.36179718
D6 180.00000000
O 0
6-311++g(2p)
****
C H 0
3-21g
****
cogito ergo sum
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 10 гостей