Разные basis sets для разных элементов?

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Леонид
Сообщения: 652
Зарегистрирован: Пн фев 16, 2004 1:18 am
Контактная информация:

Разные basis sets для разных элементов?

Сообщение Леонид » Вт июн 17, 2008 3:28 pm

В одной из статей видел что используют в вычислениях разные basis sets для различных атомов в молекуле, к примеру метал вычисляется одним, азот другим а углерод третим basis set.
Дайте пожалуста пример файла где использован такой метод вычисления.
cogito ergo sum

Shiver
Сообщения: 270
Зарегистрирован: Пт июн 23, 2006 4:44 pm

Re: Разные basis sets для разных элементов?

Сообщение Shiver » Вт июн 17, 2008 4:22 pm

Каким пакетом пользуетесь-то? :)
Racing is better than sex. The quicker you finish, the better you are.

Леонид
Сообщения: 652
Зарегистрирован: Пн фев 16, 2004 1:18 am
Контактная информация:

Re: Разные basis sets для разных элементов?

Сообщение Леонид » Вт июн 17, 2008 5:17 pm

Прошу простить :oops:
Я действительно не указал софт. Пользуюсь Gaussian98.
cogito ergo sum

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Разные basis sets для разных элементов?

Сообщение EvgeniX » Вт июн 17, 2008 10:19 pm

Вот пример со внешним ECP базисом для Zr:
------------------------
%mem=512Mb
#p opt=z-matrix pbepbe/genecp

Cp2ZrCl2 (PBE/ECP28MHF)

0 1
C
C 1 1.4
C 2 1.4 1 108.0
C 1 1.4 2 108.0 3 -1.0
C 4 1.4 1 108.0 2 1.0
H 1 1.1 2 126.0 4 178.0
H 2 1.1 3 126.0 1 177.0
H 3 1.1 2 126.0 1 179.0
H 4 1.1 5 126.0 1 -177.0
H 5 1.1 4 126.0 1 -179.0
Zr 1 2.6 2 74.0 3 65.0
C 11 2.6 1 173.0 6 1.0
C 12 1.4 11 74.0 1 -125.0
C 13 1.4 12 108.0 11 -65.0
C 12 1.4 13 108.0 14 1.0
C 15 1.4 12 108.0 13 -1.0
H 12 1.1 13 126.0 15 -178.0
H 13 1.1 14 126.0 12 -177.0
H 14 1.1 13 126.0 12 -179.0
H 15 1.1 16 126.0 12 177.0
H 16 1.1 15 126.0 12 179.0
Cl 11 2.5 1 87.0 6 49.0
Cl 11 2.5 1 88.0 6 -51.0

C 0
aug-cc-pvdz
****
Zr 0
S 3 1.0
5.8737890 -0.8394311
4.2872700 1.4322944
1.4641370 0.3960967
S 1 1.0
0.8312450 1.0
S 1 1.0
0.3623350 1.0
S 1 1.0
0.0793570 1.0
S 1 1.0
0.0339200 1.0
S 1 1.0
0.0110000 1.0
P 2 1.0
2.8742240 -4.1490377
2.1199010 3.8441952
P 2 1.0
0.8513640 0.5739450
0.4372920 0.4590635
P 1 1.0
0.2029040 1.0
P 1 1.0
0.0632590 1.0
P 1 1.0
0.0225230 1.0
D 4 1.0
2.5801370 -0.0915734
1.8553960 0.2237318
0.6807540 0.4769343
0.2566910 0.5279852
D 1 1.0
0.0894000 1.0
D 1 1.0
0.0300000 1.0
****
Cl 0
aug-cc-pvdz
****
H 0
aug-cc-pvdz
****

Zr 0
Zr-ECP 4 28
G POTENTIAL
1
2 1.000000 0.000000
S-G POTENTIAL
2
2 7.820000 146.202289
2 3.910000 18.323348
P-G POTENTIAL
2
2 6.990000 99.859830
2 3.500000 13.655859
D-G POTENTIAL
2
2 5.440000 32.237066
2 2.660000 7.660252
F-G POTENTIAL
2
2 7.510000 -21.069954
2 3.770000 -3.113384
------------------------

Леонид
Сообщения: 652
Зарегистрирован: Пн фев 16, 2004 1:18 am
Контактная информация:

Re: Разные basis sets для разных элементов?

Сообщение Леонид » Ср июн 18, 2008 11:56 am

Даный ввод логичен?
Ради примера использовал просто молекулу этанола:
%mem=6MW
%nproc=1
# opt=(tight) hf/gen scf=(qc,tight,direct,maxcycle=1000)

ethanol example

0 1
C
H 1 B1
H 1 B2 2 A1
C 1 B3 2 A2 3 D1
H 4 B4 1 A3 2 D2
H 4 B5 1 A4 2 D3
H 4 B6 1 A5 2 D4
O 1 B7 4 A6 5 D5
H 8 B8 1 A7 4 D6

B1 1.08524010
B2 1.08524010
B3 1.52454066
B4 1.08205877
B5 1.08205877
B6 1.08362390
B7 1.44434552
B8 0.96606627
A1 108.14929326
A2 110.18470376
A3 109.49555185
A4 109.49555185
A5 110.87721903
A6 106.19779937
A7 110.85780472
D1 120.48957464
D2 61.00929257
D3 179.73288693
D4 -59.62891025
D5 -59.36179718
D6 180.00000000

O 0
6-311++g(2p)
****

C H 0
3-21g
****
cogito ergo sum

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 13 гостей