новости бизнеса
компании и предприятия
нефтехимические компании
продукция / логистика
торговый центр
ChemIndex
новости науки
работа для химиков
химические выставки
лабораторное оборудование
химические реактивы
расширенный поиск
каталог ресурсов
электронный справочник
авторефераты
форум химиков
подписка / опросы
проекты / о нас


контакты
поиск
   

Новости химической науки > Новая методика анализа ДНК изучает геном неандертальцев


19.7.2009
средняя оценка статьи - 4 (2 оценок) Подписаться на RSS

Новая, более простая и дешевая методика секвенирования ДНК была использована для расшифровки и анализа митохондриального генома пятерых неандертальцев.



Исследователи отмечают, что новая методика позволяет обойти трудности, возникающие при анализе частично разрушенной древней ДНК, что позволяет лучше понять генетические черты и особенность эволюции неандертальцев и других древних видов.

В прошлом году группа под руководством Сванте Паабо (Svante Pääbo) из Института Эволюционной Антропологии Макса Планка (Лейпциг) проделала первый полный анализ митохондриальной ДНК неандертальца с помощью секвенирования методом «выстрела из дробовика» (shotgun sequencing – метод определения первичной нуклеотидной последовательности с использованием крупных стохастических фрагментов с перекрывающимися последовательностями). Тем не менее, эта методика требует больших затрат времени, в ней расходуются большие количества драгоценной древней ДНК, при реализации этой методики происходит секвенирование всех нуклеиновых кислот образца, при этом 99% всех нуклеиновых кислот, извлекаемых их древних окаменелостей обычно принадлежит бактериям и грибкам, внедрившимся в костную ткань останков.

Для того чтобы избежать трудностей, описанных выше, Паабо с коллегами разработал ускоренный, дешевый и дающий меньшее количество отходов метод реконструирования геномов древних биологических видов – метод улавливания расширения праймера [primer extension capture (PEC)]. Еще одна причина заключалась и в том, что предоставленные для изучения новые образцы оказались в плохо сохранившемся состоянии, и их анализ методом «выстрела из дробовика» мог бы стоить миллионы долларов.

Исследователи смогли «оживить» драгоценные образцы древних ДНК (например, ДНК неандертальцев), получая многие тысячи копий ДНК из каждой исходной молекулы ДНК. Многократное повторение этого процесса позволяет получить библиотеки из последовательностей анализируемых ДНК. В методике используется 5'-биотинированные олигонуклеотидные праймеры и ДНК-полимераза, позволяющие отделить ДНК неандертальцев от загрязняющих образец молекул «посторонних» ДНК. Такой подход позволяет уменьшить время на анализ образца и понизить его стоимость в несколько тысяч раз.

Источник: Science, 2009, DOI: 10.1126/science.1174462

метки статьи: #аналитическая химия, #биохимия, #молекулярная биология

оценить статью: 12345
Перепечатка статьи разрешается при условии размещения активной гиперссылки на ChemPort.Ru
Комментарии к статье:
Ваше имя
Ваш e-mail, чтобы следить за обсуждением
   
Комментарий

Символ пятого P-элемента в табл. Менделеева
(латиницей, одной заглавной буквой):
   
 


Вы читаете текст статьи "Новая методика анализа ДНК изучает геном неандертальцев"
Перепечатка статьи разрешается при условии размещения активной гиперссылки на ChemPort.Ru

Все новости



Новости компаний

Все новости


© ChemPort.Ru, MMII-MMXXIII
Контактная информация