поиск |
Новости химической науки > Как кислород присоединяется к гему?1.7.2007 Методы компьютерной химии помогли испанским ученым последовать за кислородов в его путешествии к атому железа в гем-протеидах.
Расчеты дают представление о том, как молекула кислорода связывается с гемовым центром дезоксимиоглобина. (По материалам Chem. Commun.)
В гем-протеидах, как, например, в гемоглобине и миоглобине гемовые фрагменты служат для транспорта и запасания кислорода – функций, жизненно необходимых для дыхания и процесса обмена веществ у млекопитающих. Несмотря на то, что структуры транспортирующих кислород сложных белков давно изучены, точный механизм присоединения молекулы кислорода к гемовому центру и ее высвобождения до сих пор неизвестен.
Определить способ взаимодействия кислорода с гемом непросто, так как множественность возможных конформаций белков позволяют предположить несколько потенциальных возможностей для связывания молекулы кислорода с железом в гемовом центре.
Хуан Новоа (Juan Novoa) и Йорди Рибас-Арино (Jordi Ribas-Ariño) из Университета Барселоны рассчитали различные электронные состояния молекулы кислорода и атома железа в гемовом центре для определения наиболее благоприятного маршрута для процесса связывания.
Для определения энергетических профилей присоединения O2 к дезоксигему и потери O2 оксигемом Новоа и Рибас-Арино использовали методы ab initio. Методы ab initio были выбраны благодаря тому, что при расчете с их использованием происходит учет всей энергии биологической молекулы. Это обстоятельство увеличивает точность выбранного метода в сравнении с точностью широко распространенного метода дифференцированного функционала плотности [DFT]. Расчеты испанских ученых позволили предложить новый маршрут реакции. Предполагаемый на основе результатов расчетов механизм хорошо согласуется с экспериментальным изучением обратимого связывания молекулярного кислорода к гемоглобину и миоглобину.
Источник: Chem. Commun., 2007, web advanced publish метки статьи: #биохимия, #квантовая химия, #молекулярная биология Перепечатка статьи разрешается при условии размещения активной гиперссылки на ChemPort.Ru Комментарии к статье:
Вы читаете текст статьи "Как кислород присоединяется к гему?" Перепечатка статьи разрешается при условии размещения активной гиперссылки на ChemPort.Ru |
Читайте также:
Все новости
23.3.2023 Эта новая молекула обязана своей хиральностью только кислороду. 25.12.2016 Вещества, которые нас порадовали в уходящем году 13.12.2016 Морская вода позволит освободиться от «литиевой иглы» 5.12.2016 Платина с отрицательным зарядом 29.11.2016 В «плоский мир» въехала молекула – колесо со спицами 21.11.2016 Носки превращаются в гибкие хемосенсоры Подписка на новости
Новости компаний
03.04.23
|
Химпром, ПАО
Все новости
Работа на «Химпроме» становится все более привлекательной 03.04.23 | Химпром, ПАО Работа на «Химпроме» становится все более привлекательной 03.04.23 | Химпром, ПАО Новый подход «Химпрома» к чистому воздуху и воде в Чувашии 13.12.22 | Химпром, ПАО «Химпром» присоединился к проекту «Жить и работать в Чувашии» 06.12.22 | Химпром, ПАО «Химпром» взял лидерство в реализации профориентационного проекта УПК 21 Подписка на новости
|